在水產養殖中，常用的一些菌種可以降低pH值，包括以下幾種：

1.  乳酸菌：乳酸菌可以利用糖類等有機物質產生乳酸，使水體中的pH值降低。在水產養殖中，可以利用乳酸菌對水質進行調節，保持水體的酸堿平衡。

2.  醋酸菌：醋酸菌可以利用有機物質產生醋酸，也可以將二氧化碳轉化為碳酸氫鹽，從而使水體中的pH值降低。

3.  硝化細菌：硝化細菌可以將氨氮轉化為硝酸鹽，這個過程中產生的酸性物質可以降低水體的pH值。

需要注意的是，對于不同的水產養殖系統，選用的菌種可能會有所不同，因此在具體的實踐中需要結合實際情況進行選擇和應用。同時，應注意控制菌群的數量和比例，以避免對生態環境造成不良影響。